Říše: Prokaryota


Oddělení: Bacteria (Eubacteria) - bakterie

Oddělení: Cyanophyta (Cyanobacteria) - sinice

              Řád: Chroococcales 
              Řád: Oscillatoriales
              Řád: Nostocales
              Řád: Stigonematales

Vodní květy sinic, stomatolity, sinice a řasy jako potravina



Říše: Eukaryota


Oddělení: Rhodophyta - ruduchy


Oddělení: Dinophyta (Dinoflagellata) - obrněnky


Oddělení: Cryptophyta - skrytěnky, kryptomonády


Oddělení: Chromophyta
 

      Třída: Chrysophyceae - zlativky 
      Třída: Prymnesiophyceae (Haptophyceae)
      Třída: Bacillariophyceae - rozsivky
      Třída: Phaeophyceae (Fucophyceae) - hnědé řasy
      Třída: Xanthophyceae (Tribophyceae, Heterokontae) - různobrvky
      Třída: Raphidophyceae (Chloromonadophyceae) - chloromonády
      Třída: Eustigmatophyceae


Oddělení: Euglenophyta - eugleny, krásnoočka


Oddělení: Chlorophyta - zelené řasy


      Třída: Prasinophyceae (Micromonadophyceae)
      Třída: Chlamydophyceae
      Třída: Chlorophyceae - zelenivky
      Třída: Pleurastrophyceae
      Třída: Ulvophyceae
      Třída: Zygnematophyceae (Conjugatophyceae) - spájivky
      Třída: Charophyceae - parožnatky


Oddělení: Bryophyta - mechorosty
         

Oddělení: Lycopodiophyta - plavuně


Oddělení: Equisetophyta - přesličky


Oddělení: Polypodiophyta - kapradiny


Oddělení: Magnoliophyta - krytosemenné


      Třída: Magnoliopsida - dvouděložné
      Třída: Liliopsida - jednoděložné

	
Společenstva fytoplanktonu rybníků a nádrží